先前日本車友在自己Blog 表示自己做為跑場地用途的R25 才一千公里的里程就發生了機油泵齒輪斷裂,進而令引擎受損情況,日本YAMAHA 於6/14 在官網公佈相關召回事項,而其召回車種以日本地區販售,包括YZF-R3A(ABS版)、YZF-R25A、YZF-R25、MT32MT、MT250 等兩種引擎型式五種車款,台灣YAMAHA 也隨後於6/15日於官網公告YZF-R3 與MT-03 進行自主召回。而召回原因與日本相同,不只是機油泵齒輪問題,還包括離合器軸承以及前煞車油管走線問題。
YZF-R 車系召回原因主要是引擎內部零件,包括因為機油泵浦內的壓力調整閥設計不良,導致機油泵齒輪可能在高轉的機油壓力下發生斷裂,造成引擎傷害,以及離合器壓板軸承強度不足,在頻繁換檔下可能會無法作動導致無法換檔。前者透過更換機油泵浦,後者則是更換軸承改善。